中西结合肛肠科2005年获得四川省中医重点专科；2007年获得国家“十一五”中医重点专科；2011年获得国家临床重点专科；2012年获得国家“十二五”中医药重点学科。肛肠疾病研究所2012年获批所为四川省高校重点实验室。

已形成三个稳定的研究方向：

1、肛肠疾病诊疗规范、手术操作规程及手术并发症、后遗症防治研究。

2、肠动力疾病（便秘）的临床诊治和基础研究。

3、炎性肠病的临床诊治和基础研究。

并取得多项研究成果：

1、“切挂选择缝合术治疗高位复杂性肛瘘临床研究”获2005年省人民政府科技进三等奖

2、“中西医结合治疗出口梗阻型便秘临床研究”获2007年四川省人民政府科技进步三等奖。

3、“注射切除缝合保留齿线术治疗不同类型混合痔操作规程制定及临床评价研究”获2010年四川省人民政府科技进步三等奖。

4、“腰奇穴麻醉在肛肠科手术中应用的临床研究”获2010年四川省人民政府科技进步三等奖。

5、“祛瘀止血法治疗溃疡性结肠炎实验及临床研究”获2013年四川省人民政府科技进步三等奖。